Το Villa Margarita βρίσκεται στο χωριό Καρτεράδος , 1 χλμ. από το κέντρο των Φηρών και σε κοντινή απόσταση με τα πόδια από πολλά καφέ και παραδοσιακές ταβέρνες . Το ξενοδοχείο απέχει 10 λεπτά με το αυτοκίνητο από το αεροδρόμιο της Σαντορίνης. Υπάρχει δωρεάν χώρος στάθμευσης κοντά στο ξενοδοχείο.